该试剂盒采用超灵敏高通量测序技术，深度覆盖新型冠状病毒（SARS-CoV-2）全基因组,一次测序可同时解析基因组和亚基因组RNA（sgRNA）信息。帮助科学家们快速追踪感染溯源，确定病毒传染性，及指导疫苗研发。我们还开发了生物分析平台DeepMARK pipeline，通过将测序数据上传到AI生物分析平台，可实现病毒基因组测序结果的自动化分析。
- SARS-CoV-2检测
根据检测的基因片段，分类为阳性和阴性
- 针对参考基因组的变异
与参考基因组比对，陈列样本中的病毒基因变异
- 全基因组
深度测序,可覆盖全基因组
- 亚基因组RNA（sgRNA）分析
亚基因组特征和检测丰度分析
- 更经济
比宏基因测序产生的数据量更少更精准
- 更深度全面
包含全基因组测序（WGS），及与病毒传染性相关的sgRNA分析
- 更灵敏
在低病毒载量的样本中富集效果更佳，减少假阴性
- 更准确
可判断病毒是否正在活性复制，避免假阳性
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识别新出现的新冠病毒变异
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评估患者是否具有病毒传染性
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病毒进化研究
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新冠疫苗及药物研发设计
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发现隐形传播途径
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深度全基因组+转录组测序
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覆盖率超过99%
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独特设计,可覆盖>99%的亚洲,美国和欧洲病毒株
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安全,无需耗时的病毒培养
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避免假阳性
案例：DeepMARK追踪溯源---准确定位无关联病例和病毒簇
上图采用系统发育树对来自同一社区的13例患者的病毒基因组进行可视化分析，以确定个体之间的传播路径。上图中，相关程度越高的病毒基因组实际来源于地理位置越相近的患者。 DeepMARK的数据结果将这些患者分为几个特定的基因簇，表明该社区内有多个传播路径。
产品参数
| 预期用途 | 用于SARS-CoV-2 RNA的定性分析,阳性结果表明研究样品中存在SARS-CoV-2 RNA |
| 方法 | 基于扩增子的二代测序（NGS） |
| 样本类型 | 临床样本或病毒培养基中提取的RNA |
| 适用平台 | Illumina/ 华大智造（MGI）测序平台 |
| 储存条件 | -20℃ |
| 试剂盒规格(反应) |
20 (Cat. No. DM-SC2-001-20) 50 (Cat. No. DM-SC2-001-50) |
仅供科研，不用于临床诊断。
Q & A
在感染宿主细胞时，SARS-CoV-2复制其基因组RNA（gRNA），并产生许多其他更小的RNA，被称为亚基因组RNA（sgRNA）。sgRNA编码保守的病毒结构蛋白和几种辅助蛋白。
它只能在受感染的细胞中产生，并在感染后10到11天下降。检测到sgRNA表明样本中的细胞已被感染，并证明了检测到正在自我复制扩增过程中的病毒。香港大学的研究数据已经表明，病毒培养和sgRNA检测之间存在适度的一致性，且sgRNA的存在与传染性有关。
DeepMARK在测序时能区分所检测到的序列是属于sgRNA或者是病毒自身基因组。DeepMARK通过特殊的引物设计，通过基因组的5'末端前导序列和基因组3'末端的下游ORF的存在来定义典型sgRNA的检测。可以实现同时检测病毒基因组和亚基因组信息。